Human coronavirus penyebab flu biasa

Human Coronavirus penyebab flu biasa namun mengalami mutasi. Apakah COVID-19 diakibatkan mutasi dari Human coronavirus biasa? Belum ada yang mampu membuktikannya.

aksiografi.com – Human Coronavirus 229E (HCoV-229E) merupakan salah satu strain pertama dari virus corona. Virus ini terkait dengan gejala pilek umum pada orang dewasa sehat.  

Virus corona (coronaviruses) sejak lama ditemukan jauh sebelum terjadi epidemik SARS, MARS dan COVID-19. Awalnya virus ini hanyalah virus biasa yang menyerang manusia dengan mengakibatkan sakit flu biasa.

Virus corona pada manusia atau Human Coronavirus (HCoV) pertama kali muncul dalam laporan pada pertengahan 1960an. Spesies pertama kali terdeteksi diberi nama HCoV-229E dan selanjutnya HCoV-OC43[1][2]. Spesies ini tidak mengancam nyawa seseorang penderita.  Dan sejak itu, lebih banyak lagi spesies dari coronavirus yang dideskripsikan sebagaimana yang ditulis Christian Drosten bersama rakannya dan Lia van der Hoek dari Univeristy of Amsterdam serta A.M. Zaki dan rekan-rekannya.

Virus corona 229E diidentifikasi sebagai penyebab paling umum kedua pilek setelah rhinovirus pada orang dewasa yang sehat. Gejala dominan adalah akut rhinorrhea, hidung tersumbat, dan  atau sakit tenggorokan.[3] Sengau debit adalah ciri khas dari semua gejala setelah inokulasi HcoV-229E yang kondisi sehat, dan gejala yang diamati lebih lanjut adalah malaise, sakit kepala, kedinginan, dan batuk.[4]

Strain HCoV-229E dikaitkan dengan gejala flu biasa.[5] Anak-anak muda dan orang tua dianggap lebih rentan infeksi saluran pernapasan bawah. Saluran pernapasan bagian bawah yang parah terinfeksi sejauh ini hanya pada pasien dengan sistem imun yang tertekan.[6]

Sejauh ini, belum ada laporan yang menggambarkan adanya ancaman jiwa kondisi pada orang dewasa yang dikaitkan dengan HCoV-229E. Namun pada 2017 ada satu kasus sindrom gangguan pernapasan akut (Acure Respiratory Distress Syndrom) pada orang dewasa sehat tanpa komorbiditas dan telah diidentifikasi satu-satunya agen penyebab adalah HCoV-229E.

Kasus Langka Human Coronavirus

Kasus ini menarik perhatian Foula Vassilara dan rekannya di Hygeia Hospital, Atena, Yunani. Mereka melakukan penelitian terkait kasus itu dan membuat laporan dengan judul A Rare Case if Human Coronavirus 229E Associated with Acure Respiratory Distress Syndrome in a Healthy Adult yang dipublikasikan di website hindawi.com pada 15 April 2018.

Seorang guru usia 45 tahun terpapar beberapa patogen dari murid-muridnya.  Ia masuk UGD dengan kondiri batuk kering, sakit kepala, demam hingga 39,5 derajat beberapa jam lamanya. Riwayat medisnya biasa saja. Tidak pernah merokok dan tidak pernah dalam pengobatan rutin akibat sakit.

Hasil pemeriksaan klinis menunjukkan rales di bidang paru-paru kiri bawah. Hasil Rontgen dada menunjukkan kekeruhan dankonsolidasi yang menyebar di bidang itu. Gas Darah Arteri (the Arterial Blood Gases-ABG) normal, dan diberikan intravenous ceftriaxone dan azithromycin untuk infeksi saluran pernapasan yang lebih rendah atau Lower Respiratory Tract Infection (LRTI). Antigen S. pneumoniae dan L. pneumophila dalam spesimen urin pasien negatif, dan kultur darah steril.

Namun, selama dua hari berikutnya, kondisi klinis pasien cepat memburuk dengan perkembangan takipnea (34 respirasi per menit), dispnea, dan hipoksemia. ABG berubah PaO2 of 55.3 mmHg, PCO2 of 31.4 mmHg, and pH of 7.487. Paru-paru auskultasi mengungkapkan rhonchi difus secara simetris di seluruh dadanya, pernapasan bronkial di lobus kanan dan kiri bawahnya, dan berkurang suara vesikuler. CT scan dada menampilkan efusi pleura bibasilar dan konsolidasi difus ditambah opasitas kaca tanah yang melibatkan semua bidang paru-paru (Gambar 1).

Oksigen disuplai sebanyal 5 Liter per menit, dan terapi antimikroba terapi diubah menjadi levofloxacin 500 mg per hari. Kortikosteroid sistemik dan bronkodilator ditambahkan sekitar 40 jam setelah dia dirawat di rumah sakit. Sampel cairan pleura menunjukkan eksudat dengan 260 cells/mm3, pewarnaan Gram negatif, dan kultur steril.

Sekresi hidung dikumpulkan, dan teknologi PCR multipleks diterapkan yang menargetkan beberapa patogen (RespiFinder® 22, PathoFinder), termasuk coronavirus 229E; coronavirus NL63, HKU1, dan OC43; influensa A, B, dan H1N1; parainfluenza 1,2, 3, dan 4; Mycoplasma pneumoniae; Legionella pneumophila; Bordetella pertussis; bocavirus; rhinovirus / Enterovirus; adenovirus; RSV A dan B; dan Chlamydophila pneumonia. Hasilnya adalah positif untuk HCoV-229E, sementara negatif untuk patogen yang diuji lainnya; PCR untuk SARS-CoV dan MERS-CoV juga negatif.

Dalam beberapa jam kemudian, kondisi klinis pasien semakin memburuk dan dia membutuhkan peningkatan pasokan oksigen. ABG baru menunjukkan PaO2 = 76 mmHg, PCO2 = 33 mmHg, and pH = 7.45 at FiO2 = 0.50 with PaO2/FiO2 = 152, yang menunjukkan ARDS. Pasien dalam kesulitan pernapasan parah dan tetap demam dan takipneik (tachypneic), dan rontgen X-ray dada yang baru menunjukkan beberapa konsolidasi di atas bidang paru-parunya (Gambar 2). Linezolid intravena ditambahkan ke rejimennya secara empiris untuk mengobati Staphylococcus aureus pneumonia yang diperoleh sekelompok yang memungkinkan.

Human coronavirus 229E

Dilkukan pengulangan RT-PCR satu langkah dalam sampel hidung (Taqman, in-house protokol, Hellenic Pasteur Institute) mengkonfirmasi keberadaan eksklusif dari human coronavirus 229E (HuCoV-229E). Setelah administrasi kortikosteroid sistemik, pasien mulai menunjukkan klinis perbaikan dalam 24 jam pertama. Analisis laboratorium lebih lanjut dilakukan tidak mengungkapkan adanya defek imun. Setelah seminggu, dia keluar dari rumah sakit baik dan tetap sehat 23 bulan kemudian (Gambar 3).

Human coronavirus 229E

Hasil Penelitian Human Coronavirus

Selama ini HcoV-229E dikaitkan dengan bronkitis, eksaserbasi akut Chronic Obstuctive Pulmonary Disease (COPD), dan pneumonia pada bayi, anak-anak, dan orang tua dengan penyakit yang mendasarinya.[7]

Hanya infeksi yang mengancam jiwa pada pasien immunocompromised[8], tetapi korelasi HCoV-229E dengan LRTI pada individu dewasa yang sehat tidak pasti.[9] Seorang pasien dewasa dengan pneumonia dites positif HCoV-229E seperti yang diungkapkan dalam penelitian yang dilakukan di pedesaan Thailand, tetapi tidak dibuat jelas jika ada komorbiditas lain.[10] Komorbiditas adalaha kondisi seseorang penderita disleksia yang dapat mengalami gangguan simultan

Metode RT-PCR yang baru[11] dalam dahak dan aspirasi hidung berhasil mendiagnosis human coronavirus infeksi. Multiplex RT-PCR semakin banyak digunakan untuk mendiagnosis infeksi pernafasan dan telah terbukti lebih sensitif, cepat dan hemat biaya daripada deteksi kultur virus dan deteksi antigen[12], dengan sensitivitas yang lebih besar dan spesifisitas yang serupa dibandingkan para waktu nyata RT-PCR[13].

Kasus itu adalah pertama kalinya coronavirus manusia HcoV-229E telah terdeteksi pada infeksi saluran pernapasan bawah parah dengan ARDS dari orang dewasa yang sehat tanpa komorbiditas. Tim itu menyarankan bahwa keberadaan HciV-229E seharusnya tidak diremehkan dan dianggap sebagai patogen yang mungkin bahkan koinfeksi dengan mikroorganisme lain dalam LRTIs lebih serius.

Alasan mengapa HuCoV-229E yang menyebabkan manifestasi klinis yang berbeda dalam kelompok pasien yang beragam belum terjawab. Proses di mana HCoV-229E dapat menghindari pertahanan dan penyebab kekebalan tubuh yang normal sehingga menimbulkan penyakit yang mengancam jiwa masih harus dijelaskan.

Apakah Human coronavirus ini bagian awal dari sejarah human coronavirus yang mengguncang dunia saat ini oleh COVID-19? Atau dua hal yang berbeda dan terpisah. Belum ada yang meneliti secara detaik hubungan keduanya.


Referensi:

[1]              D. Hamre and J. J. Procknow, “A new virus isolated from the human respiratory tract,” Experimental Biology and Medicine, vol. 121, no. 1, pp. 190-193, 1966.

[2]              K. McIntosh, J. H. Dees, W. B. Becker, A. Z. Kapikian, and R. M. Chanock, “Recovery in tracheal organ cultures of novel viruses from patients with respiratory disease,” Proceedings of the National Academy of Sciences Proceedings of the National Academy of Sciences, vol. 57, no. 4, pp. 933-940, 1967.

[3]              M. J. Makela, T. Puhakka, O. Ruuskanen et al., “Viruses and bacteria in the etiology of the common cold,” Journal of Clinical Microbiology, vol. 36, no. 2, pp. 539-542, 1998.

[4]              A. F. Bradburne, M. L. Bynoe, and D. A. Tyrrell, “Effects of a “new” human respiratory virus in volunteers,”British Medical Journal, vol. 3, no. 5568, pp. 767-769, 1967.

[5]              A. F. Bradburne, M. L. Bynoe, and D. A. Tyrrell, “Effects of a “new” human respiratory virus in volunteers,” British Medical Journal, vol. 3, no. 5568, pp. 767–769, 1967.

[6]              M. J. Makela, T. Puhakka, O. Ruuskanen et al., “Viruses and bacteria in the etiology of the common cold,” Journal of Clinical Microbiology, vol. 36, no. 2, pp. 539-542, 1998..

[7]              K. G. Nicholson, J. Kent, V. Hammersley, and E. Cancio, “Acute viral infections of upper respiratory tract in elderly people living in the community: comparative, prospective, population based study of disease burden,” British Medical Journal, vol. 315, no. 7115, pp. 1060-1064, 1997.

[8]              F. Pene, A. Merlat, A. Vabret et al., “Coronavirus 229E-related pneumonia in immunocompromised patients,” Clinical Infectious Diseases, vol. 37, no. 7, pp. 929-932, 2003.

[9]              M. J. Makela, T. Puhakka, O. Ruuskanen et al., “Viruses and bacteria in the etiology of the common cold,” Journal of Clinical Microbiology, vol. 36, no. 2, pp. 539-542, 1998.

[10]            R. K. Dare, A. M. Fry, M. Chittaganpitch, P. Sawanpanyalert, S. J. Olsen, and D. D. Erdman, “Human coronavirus infections in rural Thailand: a comprehensive study using real-time reverse-transcription polymerase chain reaction assays,” Journal of Infectious Diseases, vol. 196, no. 9, pp. 1321-1328, 2007.

[11]            E. R. Gaunt, A. Hardie, E. C. Claas, P. Simmonds, and K. E. Templeton, “Epidemiology and clinical presentations of the four human coronaviruses 229E, HKU1, NL63, and OC43 detected over 3 years using a novel multiplex real-time PCR method,” Journal of Clinical Microbiology, vol. 48, no. 8, pp. 2940-2947, 2010.

[12]            S. Bellau-Pujol, A. Vabret, L. Legrand et al., “Development of three multiplex RT-PCR assays for the detection of 12 respiratory RNA viruses,” Journal of Virological Methods, vol. 126, no. 1-2, pp. 53-63, 2005.

[13]            M. L. Choudhary, S. P. Anand, M. Heydari et al., “Development of a multiplex one step RT-PCR that detects eighteen respiratory viruses in clinical specimens and comparison with real time RT-PCR,” Journal of Virological Methods, vol. 189, no. 1, pp. 15-19, 2013.